Tentera Jerman berada di luar Paris. Georg melarikan diri ke Marseille pada saat terakhir. Bagasinya membawa warisan seorang penulis bernama Weidel, yang membunuh diri kerana takut dianiaya. Antara warisan tersebut ialah manuskrip, surat, dan jaminan visa daripada Kedutaan Mexico. Hanya ini boleh membuktikan mereka telah dibenarkan meninggalkan bandar pelabuhan, yang juga memerlukan permit masuk daripada negara tuan rumah yang berpotensi. Dengan mengandaikan identiti Weidel, Georg cuba mendapatkan akses kepada beberapa laluan yang terhad di kapal itu. Perbincangan antara pelarian berlaku di koridor hotel kecilnya, di ruang menunggu konsulat, dan di kafe dan bar di tepi pelabuhan. Georg membantu menjaga anak lelaki mendiang rakan seperjuangannya Heinz, yang meninggal dunia ketika melarikan diri. Tetapi rancangannya berubah apabila dia bertemu dengan gadis misteri Mary. Transit adalah berdasarkan novel eponim Anna Seghers tentang Perang Dunia II yang ditulisnya Filem ini berlatarkan Marseille moden, di mana orang dari masa lalu muncul di mana-mana. Oleh itu, pelarian dari masa lalu bertemu pelarian dari hari ini, sejarah bertemu masa kini, dan semua kisah mereka bergabung untuk mewujudkan satu ruang transit yang kekal.