"Dune 2" mengikuti plot filem pertama, menceritakan kisah Paul Atreides (lakonan Timothée Chalamet) yang bertemu dengan Frey di planet Arrakis selepas dimusnahkan oleh Maharaja Padishan dan pahlawan wanita Qini (lakonan Zendaya ) dan perjalanan legendanya selepas menyertai Fremen. Paul berperang melawan konspirator yang memusnahkan keluarganya, sambil menghadapi dilema memilih antara cinta dalam hidupnya dan nasibnya di alam semesta yang diketahui.